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细胞STR鉴定-细胞的“身份证”

细胞STR鉴定-细胞的“身份证”:哺乳动物细胞被错误鉴定、存在交叉污染的情况也同时存在着。如果认错了细胞系:1、浪费时间和科研经费;2、实验结果不可重复、科研结果不可靠;3、会被学术期刊拒收或撤稿。有了细胞STR鉴定,你的细胞也是有“身份”的细胞啦!而且科研成果更可靠,也不用担心发表科研文章时的细胞鉴定问题了!..

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细胞STR鉴定-细胞的“身份证”

发布时间:2024-04-04 20:42:21 热度:140

      细胞STR鉴定-细胞的“身份证”

      在过去的几十年间,细胞生物学领域的文章一直在发表,科研成果一直在公布,然而,当中哺乳动物细胞被错误鉴定、存在交叉污染的情况也同时存在着。

      如果认错了细胞系,后果可想而知:

      1、浪费时间和科研经费;

      2、实验结果不可重复、科研结果不可靠;

      3、会被学术期刊拒收或撤稿。

      最可怕的错用是在瑞典某大学的一个研究组里,该研究组从1988年起就错误的使用了Hela,以为是lnt-407细胞系,并因此在从1988到2011年里发表了41篇论文,全部是错的。这些文章发在Oncogen,JBC,Car- cinogenesis,PLoS One,J Cell Physiol, Cancer Res,Br J Cancer, Bio- chem J, Exp Cell Res等众多热门杂志上。

      从国内/国外来源细胞的情况统计结果看,Hela细胞绝对“搅屎棍”的地位不容撼动!除此之外,在2001年,科学家在一篇论文里报道了一株新建立的大鼠视网膜神经节的细胞系,命名为RGC-5。在随后的十几年时间里,至少230篇论文的研究与假设是建立在这株细胞系上。结果在2009年,序列测定结果表明,RGC-5是一株小鼠(mouse)细胞。

      所以,你需要“细胞身份证明”一细胞STR鉴定

      近年来,大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一,STR 基因分型应用于细胞鉴定已被 ATCC等机构强烈推荐,美国的ATCC细胞库、德国的DSMZ细胞库以及日本的JCRB细胞库等为STR 分型提供了各细胞株的数据供对比。

      STR基因位点由长度为3~7个碱基对的短串连重复序列组成,这些重复序列广泛存在于人类基因组中,可作为高度多态性标记,被称为细胞的DNA指纹,其可通过PCR(聚合酶链式反应)来检测,STR基因座位上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分,在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测技术来识别,随后通过一定的计算方法,即可根据所得的STR分型结果与专业的细胞STR数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能交叉污染的细胞系名称。

      截止到目前,细胞系鉴定问题已有50年历史,所谓细胞系鉴定,即通过STR(短串联重复)图谱所建立细胞系的遗传特征。一株细胞系的遗传特征确立后,细胞系可以通过定期的检测,以防止出现细胞系被误认或交叉污染的情况。

      何时需做细胞系鉴定?

      1.发表文章或申请课题经费前

      2.使用细胞进行临床治疗(试验)前

      3.准备冻存保种或已冻存多年的细胞

      4.一个涉及到细胞试验项目开始/结束时

      5.新得到的细胞或实验室培养5代以上的细胞

      6.细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大

      如何减少细胞系交叉污染?

      1.从信誉良好的组织或机构获得细胞系

      2.良好的文档编制方法

      3.训练有素的技术操作员

      4.每种细胞系单独使用培养基

      5.溶液或试剂分装使用

      6.常规性地注意细胞系身份以及其特性是否发生污染

      7.早期做好充足的冻存储备

      8.细胞培养代数不要太高

      可参考的人源细胞STR位点信息:

D19S433

D5S818

D21S11

D18S51

D6S1043

AMEL

D3S1358

D13S317

D7S820

D16S539

CSF1PO

Penta D

D2S441

vWA

D8S1179

TPOX

Penta E

TH01

D12S391

D2S1338

FGA

      可参考的人源细胞系21基因位点STR分型图谱:

 人源-STR-副本-2.jpg

      可参考的小鼠细胞STR位点信息:

18-3

4-2

6-7

19-2

1-2

7-1

8-1

1-1

3-2

2-1

15-3

6-4

13-1

11-2

TH01

D5S818

17-2

12-1

5-5

X-1


      可参考的小鼠细胞系21基因位点STR分型图谱:

小鼠-STR-4.jpg

      有了细胞STR 鉴定,你的细胞也是有“身份”的细胞啦!而且科研成果更可靠,也不用担心发表科研文章时的细胞鉴定问题了。

      华科基因作为国内早期一批细胞STR鉴定检测研究的团队,在STR方面有着稳定,严谨的检测技术,同时具备物种STR位点开发能力。目前不仅能做人源、小鼠细胞STR鉴定;还开发出了,猴源、仓鼠STR位点,能做猴源细胞STR鉴定和仓鼠细胞STR鉴定。


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